对于制造药l物，IPA 99%用于创建、纯化和分析化合物，以及净化反应器。无论是合成氨基酸还是多肽，它都是一种质子溶剂，适用于许多多步有机反应。
IPA 99%也适用于运行实验室分析，如HPLC、GC、荧光或 TLC，以表征和量化化学品。乙l腈（一种用于反相 HPLC 和 UPLC 的常用溶剂）在全l球范围内短缺，因此科学家们开发了更多含有IPA的洗脱液系统。由于该等级经过微米过滤且不挥发物含量低，因此不需要进一步过滤。由于它受紫外线吸收率控制，因此适用于关键分析。
IPA 99%用于医l疗机构的一般消毒。医院和诊l所使用 IPA 对医l疗设备进行消毒、清洁表面以及进行皮肤护理和敷料。由于它的闪点低，因此应远离火源储存。食品行业使用99%的IPA来处理染料、釉料、补充剂、醋，以及对表面、反应器、工具和大桶进行消毒。由于积水会滋生细菌，亲水性IPA会将其冲走，从而在蒸发过程中对设备进行消毒。USP级IPA不含有毒污染物，适用于清洁用于制造食品或饮料的表面。
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